Come ogni gioco che si rispetti, anche il gioco di Mutant Chronicles ha il suo bel regolamento. Durante il tempo ci sono state varie espansioni del gioco, che parte dal nucleo chiamato DoomTrooper, ed anche il regolamento ha subito vari cambiamenti.
Il Regolamento sottostante è un riadattamento per il sito di quello che potete scaricare da Mutant.it.

1. Obbiettivo
2. Le carte, il mazzo da gioco e i punteggi
3. La partita
4. Le carte
1. Differenti tipi di carte
2. Icone di affiliazione
3. Icone postplay
5. Preparazione del gioco
6. Ordine di gioco
7. Note. Regole particolari da osservare